A schengeni normáknak megfelelő terminállal a meglévő 1200 m2-es épület 3500 m2-re növekszik. Az épület átalakítása és bővítése Magyarországnak a schengeni egyezményhez történő csatlakozása miatt vált elengedhetetlenné. A Schengeni Ellenőrző Bizottság 2006. június 24-én megtartotta ellenőrzését a repülőtéren, és a terveket és a kivitelezés előrehaladott állapotát megfelelőnek találták. A bővítéssel a debreceni légikikötő alkalmassá válik akár évi 150-200 ezer főnyi utasforgalom kezelésére is.

Az épület bővítése által megvalósul az EU-n belülről és kívülről érkező járatok teljes – időbeli korlátozás nélküli – elválasztása, továbbá egy időben 2-2 induló és érkező, 180 férőhelyes repülőgép kezelése válik lehetővé. Az épület bővítése mellett a kiszolgálási és biztonsági szint is jelentősen növekedni fog, melyeket a kiépített kamerarendszer, a vizuális információs rendszer, piktogramok, csomagröntgenek, fémdetektor kapuk biztosítanak.